Resumo: O objetivo deste trabalho foi descrever a ocorrência do Tulip breaking virus (TBV, sinonímia Lily mottle virus - LMoV) quarentenário e do Lily symptomless virus (LSV) e suas análises moleculares, para fornecer dados para a remoção do TBV da lista brasileira de pragas quarentenárias A1, pois este vírus está disseminado pelos principais cultivos comerciais de lírio no Brasil. A ocorrência desses vírus foi detectada em 12 regiões produtoras, por meio da reação de transcrição reversa multiplex (RT-PCR), com uso de iniciadores específicos para os genes das respectivas capas proteicas (CP). Foram sequenciados oito fragmentos de 800 nucleotídeos (nt), obtidos de lírios infectados com LMoV, e nove fragmentos de 600 nt, obtidos de lírios infectados com LSV. A reconstrução da árvore filogenética mostrou um ramo robusto que continha as sequências brasileiras de LMoV, outros isolados de LMoV, TBV e Tulip band breaking virus, o que indica que todos são isolados de LMoV, embora agrupados em dois subgrupos. A análise filogenética também mostrou um ramo robusto que suporta todas as sequências brasileiras e outras de LSV, com exceção de um isolado japonês de LSV. Análises de recombinação também mostraram um isolado recombinante de LMoV, enquanto nenhum evento de recombinação foi detectado em LSV. Lily mottle virus é prevalente em cultivos de lírios no Brasil, em infecções simples e mistas com LSV ou Cucumber mosaic virus (CMV).

Abstract: The objective of this work was to describe the occurrence of quarantine Tulip breaking virus (TBV, synonym Lily mottle virus - LMoV) and Lily symptomless virus (LSV), and their respective molecular analyses, to provide data for supporting TBV removal from the Brazilian A1 quarantine pest list, since this virus has spread among the main commercial lily crops in Brazil. The occurrence of these viruses was detected in 12 cultivation areas through multiplex reverse transcription (RT-PCR), using specific primers to genes encoding the respective coat proteins (CP). Eight fragments of 800 nucleotides (nt) obtained from the LMoV-infected lilies and nine fragments of 600 nt from LSV-infected lilies were sequenced. Phylogenetic tree reconstruction showed a robust branch containing the LMoV Brazilian sequences, other LMoV isolates, TBV, and Tulip band breaking virus, suggesting that all are LMoV isolates, although they are clustered into two subgroups. Phylogenetic analysis also showed a robust branch supporting all Brazilian and other LSV sequences, except for an LSV Japanese isolate. Recombination analyses also showed an LMoV recombinant isolate, whereas no recombination events were found among LSV isolates. Lily mottle virus is the prevalent virus in lily crops in Brazil, in single and mixed infections with LSV or Cucumber mosaic virus (CMV).

O objetivo deste trabalho foi caracterizar biológica e molecularmente três isolados de Sugarcane mosaic virus (SCMV) de lavouras de milho, analisá-los filogeneticamente e discriminar polimorfismos do genoma. Plantas com sintomas de mosaico e nanismo foram coletadas em lavouras de milho, no Estado de São Paulo e no Município de Rio Verde, GO, e seus extratos foliares foram inoculados em plantas indicadoras e submetidos à análise sorológica com antissoros contra o SCMV, contra o Maize dwarf mosaic virus (MDMV) e contra o Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Mudas de sorgo 'Rio' e 'TX 2786' apresentaram sintomas de mosaico após a inoculação dos três isolados, e o DAS-ELISA confirmou a infecção pelo SCMV. O RNA total foi extraído e usado para amplificação por transcriptase reversa seguida de reação em cadeia de polimerase (RT-PCR). Fragmentos específicos foram amplificados, submetidos à análise por polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP) e sequenciados. Foi possível discriminar os genótipos de SCMV isolados de milho de outros isolados brasileiros do vírus. Alinhamentos múltiplos e análises dos perfis filogenéticos corroboram esses dados e mostram diversidade nas sequências de nucleotídeos que codificam para a proteína capsidial, o que explica o agrupamento separado desses isolados e sugere sua classificação como estirpes distintas, em lugar de simples isolados geográficos.

The objective of this work was to characterize biologically and molecularly three Sugarcane mosaic virus (SCMV) isolates from maize crops in Brazil, to analyze them phylogenetically and to discriminate genome polymorphisms. Plants with mosaic and stunting symptons were collected from maize crops in the state of São Paulo and in Rio Verde county, GO, Brazil; their foliar extracts were inoculated in indicator plants and subjected to serological analysis with antisera to SCMV, Maize dwarf mosaic virus (MDMV) and Johnsongrass mosaic virus (JGMV). Sorghum 'Rio' and 'TX 2786' seedlings showed mosaic symptons after inoculation of the three isolates, and DAS-ELISA confirmed infection by SCMV in these plants. Total RNA was extracted from the infected leaves and was used as template for reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). Specific fragments were amplified, subjected to restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis and sequenced. It was possible to discriminate the SCMV maize isolates from other Brazilian isolates of the virus. Multiple alignments and phylogenetic profile analyses corroborate these data and show diversity in the sequence of nucleotides that code for capsidal protein, what explains the distinct clustering of these isolates, suggesting that they should be ranked as distinct SCMV strains rather than geographical isolates.